Во-первых, ученые не определились кто от кого произошел:"
По одной из гипотез, ретровирусы могли произойти от ретротранспозонов — подвижных участков генома эукариот" (клеточных организмов).
Во-вторых, сами авторы вашей статьи пишут:
"За миллионы лет эволюции встроившиеся в геном части вирусов также претерпели изменения, и в данный момент остались в основном дефектные их части или очень короткие фрагменты. Мутации, накопившиеся в ходе эволюции в эндогенных ретровирусах, не позволяют им образовывать новые инфекционные вирусные частицы."
В-третьих, пофантазируем

. Допустим, возможна печать ДНК с РНК. Чем это грозит в случае мРНК вакцины? мРНК несет информацию об одном белке коронавируса, по которому его идентифицирует иммунка. Она по сути является матрицей для его печати. Даже если вдруг(!) она встроится в ДНК, сможет напечататься только один белок, а не целый вирус. Если хотите ****огию: белок - шильдик авто, а вирус - сам автомобиль. мРНК - инструкция по созданию шильдика, и автомобиль из нее не получится.
В-четвертых. Классические вакцины как раз содержат фрагменты, а иногда и всю ДНК\РНК вируса. Почему Вы им больше доверяете?
Самое простое объяснение - это обломки РНК коронавируса. Не всегда патоген, попав в организм, вызывает заболевание. Ведь есть местный иммунитет, инфицирующая доза.