Заинтересовался я вопросом возможной взаимосвязи заболеваемости этим новомодным вирусом и распространенностью разных вариантов HLA в разных популяциях.
И выдал мне гугл вот эту вот работу:
⚠ Тільки зареєстровані користувачі бачать весь контент та не бачать рекламу.
В ней исследована (правда на относительно небольшой и достаточно специфической выборке) эта взаимосвязь для "предыдущей версии" вируса, вызвавшего эпидемию SARS на юге Китая в начале нулевых.
В общем, что там удалось обнаружить. Вот что:
1. Identified risk factors of SARS-CoV infection included ... carrying the HLA-Cw*0801 allele.
2. HLA-SARS case-control studies revealed that HLA-Cw*1502 and DRB1*0301 genes might be the resistance factors of SARS infection
3. During the analysis of SARS infected patients and the high-risk medical staff, the researchers found that HLA-B*4601 and HLA-B*5401 might be the most probable factors assisting SARS-CoV infection
4. The severity of SARS was significantly correlated with HLA-B*4601
5. Study determined a strong correlation between SARS development and HLA-B*0703 and DRB1*0301
6. Compared with the expected value in ordinary people, the joint inheritance rate of B*0703 and B60 showed a significant increase in the SARS patient group
7. Compared with the control groups, HLA-DRB1*12 occurred more often in the SARS patient group
8. HLA-DRB1*1202, the dominate gene in Vietnamese, showed the strongest correlation with SARS in the dominant model
Что все это значит. Вот что:
1. Следующие аллели увеличивают риск заболевания SARS: Cw*0801 B*4601 B*5401 B*0703 B60(?) DRB1*1202 и в некоторой степени DRB1*12
2. При этом B*4601 также увеличивает и тяжесть протекания заболевания.
3. Обладание Cw*1502 и DRB1*0301 напротив, оказывает защитное действие и повышает сопротивляемость инфекции.
Теперь изучаем распространенность данных аллелей в разных популяциях (я использовал открытую базу института трансплантной иммунологии при Ливерпульском университете):
Cw*08:01 наиболее часто встречается у китайцев (до 37% у China Yunnan Bulang), у филиппинцев, тайваньцев и т.п. А также у полинезийцев и американских ******ев (и как следствие - в некотором количестве у бразильцев, мексиканцев и т.д.). При этом неожиданно высокую частоту этой аллели можно видеть у иранцев (Iran Gorgan 13%)
B*46:01 Это тот самый вариант, который не только способствует заболеванию, но и значительно отягощает течение болезни. С ним все проще. Максимума он достигает на юге Китая (Гуанчжоу 25%) , по мере удаления от этого региона его частота снижается. Фактически с заметной вероятностью он присутствует только у азиатов.
B*54:01 Тут интересно. Максимум (12%) у американских латинос (USA Spain Ancestry), далее идут USA Hawaii Okinawa, 9% дают японцы и частота этой аллели падает по мере движения на запад. Фактически это тоже азиатская аллель, однако по какой-то причине часто встречающаяся в США у людей латиноамериканского происхождения.
B*07:03 Здесь база данных выдает заметную частоту (4%) только для иранцев. Опять все те же Iran Gorgan
DRB1*12:02 это очень распространенная аллель в юго-восточной Азии. 56% у China Yunnan Bulang, более 50% у индонезийцев и т.д. Также ее полно у жителей Полинезии (Кирибати 37%, Науру 28%). По мере удаления от основного "ареала" ее частота снижается (4% у бурятов, 3% на севере Индии). Однако даже в Камеруне ее около 1%
DRB1*12 включает в себя предыдущую и имеет такой же ареал, с более высокими частотами (так как к ней относятся кроме DRB1*12:02 еще и DRB1*12:01 например). Есть она у жителей Москвы (2%), Архангельска (2%), немцев и португальцев (по 1.8%) и т.д.
Теперь защитные аллели Cw*15:02 и DRB1*03:01
Распространенность первой с трудом подчиняется какой-либо логике и мы имеем вот что (в порядке убывания):
******ы Колумбии 44%, австралийские ********* 28%, цыгане из Болгарии 27%, курды из Грузии 16%, цыгане из Испании 15%, сингапурцы 10%, тамилы 10%, друзы 7% и т.д.
По всей видимости, это достаточно редкая аллель южноиндийского происхождения, которая из-за случайных факторов резко повышала свою концентрацию в маленьких изолированных популяциях.
А вот со второй проще.
Сардинцы 56%, иранцы (Iran Baloch) 29%, тунисцы и испанцы по 20%. Ну и в целом она характерна для ****** и западной Европы (вероятно она связана с земледельцами неолита и их миграциями). В восточной Европе и Иране ее около 10%, еще меньше в Азии и Африке, но в целом она распространена по всему миру.
Какие можно сделать выводы? Сразу оговорюсь, что я не вирусолог и не иммунолог -но некоторые предположения представляются достаточно очевидными.
Самое банальное: есть популяции и народы более восприимчивые к вирусу и менее восприимчивые. При этом разница в восприимчивости видимо может превышать разницу, вызванную разными уровнями медицины.
Найденную бОльшую склонность азиатов к заболеванию не следует воспринимать без учета того, что эпидемия SARS и была только в Азии, а стало быть возможные европейские и африканские аллели с высокой склонностью к болезни не были обнаружены, хотя они существуют. Тем не менее, она тоже довольно показательна.
Некоторые редкие аллели (например Cw*15:02) показали свою значимость во влиянии на развитие болезни (в том числе в более легком ее протекании).
Очень любопытна также повышенная склонность некоторых иранцев к заболеванию.
PS Новый вирус все же имеет отличия от старого, и они могут коснуться в том числе и того, какие аллели более восприимчивы к новой версии.
Что безусловно, тоже очень важный шаг.