пусть Саша расскажет.
у него это однозначно получится лучше чем у меня.
В общем так.
Как я уже сказал, вирусы существуют с момента возникновения жизни на Земле.
Часть их тогда и появилась и по-сути являются альтернативной формой жизни.
В РНК-мире некоторые протоорганизмы (рибозимы - по сути самовоспроизводящиеся молекулы РНК) научились синтезировать белки, которые имеют бОльшую каталитическую активность чем сама РНК и научились сохранять свою наследственную информацию в виде ДНК (которая гораздо лучше ее хранит чем подверженная постоянным ошибкам РНК, но зато сама по себе не может ни себя копировать, ни делать что-либо еще). В итоге появилось нечто, что можно назвать первичными клетками (мембраны у них скорее всего появилсь позже, так как у бактерий и архей они сильно разные) - некоторые молекулы РНК образовали рибосомы, которые синтезировали белки по инструкциям, которым им передавали другие молекулы РНК, считанные с матрицы ДНК. ДНК же хранила информацию и о тех и о других
Естественно при этом были и такие молекулы РНК, которые в принципе были не нужны для всего этого и информация о них не сохранялась в ДНК, но тем не менее успешно пользовались всем этим процессом, копируя самих себя в итоге. Это были первые вирусы.
Затем клетки обзавелись мембранами, полноценным функционалом, стали собственно первыми микроорганизмами. Также они научились уничтожать ненужные молекулы РНК (этот функционал есть у всех живых организмов). Но те в ответ обзавелись оболочками из белков и иными механизмами, которые позволяли им избегать уничтожения и пользоваться клеточными механизмами для самовоспроизводства. То есть стали полноценными вирусами.
Дальнейшее эволюционное взаимодействие привело к огромному разнообразию вирусов. Некоторые из них тоже научились использовать ДНК для хранения своей информации и стали ДНК вирусами (например вирусы герпеса). Мало того, они научились встраивать свою ДНК в ДНК клетки, тем самым полностью обезопасив себя от уничтожения (но став сильно зависимыми от ее деления и роста). При этом по соседству со своей ДНК они размещали участки, которые заставляли клетку периодически активно считывать этот кусок ДНК, что необходимо для размножения вируса. Правда это не всегда срабатывало -и часто вирусы оказывались заперты в чужой ДНК без каких-либо надежд на размножение.
В итоге эволюция получила мощнейший инструмент. Теперь некоторые куски ДНК могли перемещаться между разными организмами, а также внутри ДНК одного организма. Не всегда вирус после "пробуждения" захватывал только свою ДНК, очень часто случайно забирал и кусок той, что принадлежала клетке. а потом он мог попасть в другой организм и встроить ее в ДНК этого организма.
Если ДНК вируса встраивалась в половую клетку -то она передавалась потомкам организма даже без активации вируса. Геном человек содержит огромнейшее число ДНК вирусов, которые в него встроились. Не всегда вирусы встраивались аккуратно - часто они вызывали либо активацию каких-то генов, либо подавление. Один из вирусов, встроившийся в зону промотора (регулятора активности) гена, ответственного за деятельность нейронов судя по всему и поспособствовал появлению развитого мозга у человека. Также другой вирус способствовал появлению плаценты у млекопитающих.
