Исследователи нашли возможного виновника тяжелых случаев коронавируса.
В борьбе с covid-19 может быть важно сосредоточиться на белке ORF8, который помогает коронавирусу SARS-CoV-2 проникать в клетку-хозяина, выбивая из строя иммунную систему. Об этом заявили исследователи из Сингапура в статье, опубликованной в журнале Lancet. Также они обнаружили в вирусе мутацию, не вызывающую столь серьезного течения болезни. У этой мутации не хватает 382 нуклеотидов в геноме коронавируса в начале последовательности ORF8, и поэтому она обозначена как ∆382.
В Сингапуре с 22 января по 21 марта с помощью ПЦР-тестов выявили 432 инфекции. 276 из них смогли провести анализ вирусной РНК, семьдесят процентов были инфицированы вирусом дикого типа, 22 процента - мутациями ∆382, а остальные - комбинациями обоих вариантов коронавируса.
У людей, зараженных 2382, вообще не было насыщения кислородом, что затронуло почти треть людей, инфицированных «дикой» формой. Людям, инфицированным мутацией ∆382, не требовалось подключение респиратора, даже если у них была пневмония, и болезнь протекала легче при более низких температурах. Никто, инфицированный этой мутацией, не был госпитализирован, и никто не умер. ∆382-инфекции имели более низкий уровень цитокинов, поэтому их иммунный ответ был менее серьезным.
Мутация ∆382 была обнаружена в трех вспышках в Сингапуре в январе и феврале. Он принадлежал некоторым китайцам, вернувшимся из Ухани.
В этой мутации белок ORF8 был заменен на белок ORF7a. Хотя в Сингапуре, где мутация была доминирующей на второй неделе, мутация не появлялась с марта, она была зарегистрирована у 345 человек в Бангладеш, 128 в Австралии и 62 в Испании. Из Китая эта мутация распространилась на Тайвань.
Хотя в исследовании не рассматривается возможность того, что текущее более легкое течение болезни у инфицированных в Европе может быть связано с изменениями в последовательности гена, описывающего ORF8, авторы указали на важность белка ORF8 в заболевании.
Исследователи сказали, что может быть важно сосредоточиться на лечении, поскольку нарушения последовательности генов в секции ORF8 важны для адаптации вируса к человеку-хозяину.
Значение белка ORF8
Роль белка ORF8, с помощью которого вирус прикрепляется к инфицированным клеткам, уже была обнаружена американскими исследователями из Калифорнийского университета и Национальной лаборатории Лоуренса Беркли. Рентгеновская кристаллография показала, что белок ORF8 в новом коронавирусе имеет уникальную форму пары идентичных молекул, которая отличается от аналогичного возбудителя эпидемии атипичной пневмонии на рубеже 2002 и 2003 годов.
Команда под руководством Джеймса Херли заявила, что именно потому, что белок создается путем объединения двух молекул, ему удается избежать иммунных реакций организма. У него есть два места для подключения к камере.
ORF8 является одним из самых быстрорастущих белков, вторгающихся в клетки-хозяева в бета-коронавирусах, включая SARS-CoV-2. После того, как вирус прикрепляется к инфицированной клетке, белок ORF8 позволяет ему проникнуть в нее.
Кроме того, было показано, что ORF8 отвечает на реакцию иммунной системы на инфицированный организм, снижая активность главного комплекса гистосовместимости MHC-1, который распознает чужеродные структуры, такие как вирусные белки, на поверхности клетки.
ORF8 также снижает эффективность интерферонов первого типа, которые предотвращают репликацию вируса в инфицированных клетках. «Эти наблюдения показывают, что взаимосвязь между структурой, функцией и вариациями последовательности ORF8 может быть ключом к пониманию того, как SARS-CoV-2 стал смертельным патогеном для людей», - добавил Херли.
Родственный вирус также показал белок ORF7a, который имеет наиболее похожее ядро белка ORF8, но является половинным, это не две цепи молекул, поэтому у него нет двух сайтов, через которые он может прикрепляться к клетке. Следовательно, covid-19 более заразен.
Об этой разнице сообщили в начале года во время первого исследования нового коронавируса методом рентгеновской кристаллографии. В то время, однако, говорили, что это только ускорило распространение.
Мутации, в которых выпадает нуклеотид, также привели к ослаблению эпидемии атипичной пневмонии. После передачи вируса от циветты человеку цепочка из 29 нуклеотидов упала. Заражение этим вариантом вируса протекало легче, чем ОРВИ.
Така фигня, малята 