как раз мой случай. сканер не смог считать отпечатки указательных пальцев, инспектрор сказала что такое бывает часто, типа подушечки пальцев от природы гладкие бывают и их трудно отсканировать. Поэтому оформили мне паспорт без отпечатков.
Вот теперь надеюсь на границе ЕС меня не развернут обратно.