Не совсем понятна суть вопроса. Пусть вам сначала ваш программист посмотрит в чем проблема. Возможно вам нужно что с запросами сделать. Если же проблема не в сайте, тогда попробуйте сменить хостинг. У меня некоторое время назад была похожая ситуация. Тоже заметил сайт начал медленее работать. Я позвонил в техподдержку uh.ua (у меня хостинг у этих ребят). В первый раз мне посоветовали поправить SQL запросы. А в другой раз увеличилась посещаемость, и стало больше файлов сайта, и мне пришлось брать VPS.