Всё зависит от качества капрона. Может вы обращали внимание как некоторые капроновые изделия пролежавшие на солнце начинают крошиться. Другие начинают плыть. И только третьи сохраняют свои свойства.
Поэтому есть некоторый риск опускать насос на капроновом тросе. Кроме того капроновый трос под весом насоса может растянуться и насос упрётся в дно скважины. Для одних насосов это не критично, с верхним или боковым забором воды. Но если забор воды осуществляется снизу, то это может произвести к выходу из строя насоса.