На винде в меню Пуск, в командной строке наберите %appdata%
Зайдите в Roaming, откройте папку BitTorrent и посмотрите. Там клиент хранит все торрент файлы.
Если их все удалить, программа потеряет связь со скачанным и в строках закачек будет ошибка инвалид чек.
Кстати, быстрый и удобный способ попасть в скрытый раздел - вручную выкорчевать/отредактировать остатки удаленных/переустановленных программ.
Снос можно и Revo Uninstaller доверить, но это для ленивых))