Эээ, кажется XMPP-сервер OpenFire всё умеет, если соответвующий по возможностям клиент подключить.
Чтоб ekiga работала локально без инета, не активируйте акаунты на внешних прокси серверах и на ekiga. net, а обращаться в локалке друг к другу как-то так user@host, в качестве хоста можно указать ip. Также под винду портирован linphone, но деталей не знаю, с виндовс не работаю, сорри