Чем больше размер кластера, тем быстрее будет работать флэшка. Я заметила, что с маленьким размером кластера зачастую флэшки долго записывают даже большие файлы. (Раньше Я всегда форматировала флэшки с кластером 4КБ, но заметила что они сильно тормозят, в отличие от флэшек с кластером 32 КБ)
Но зато с мелким размером кластера экономится место на множестве мелких файлов.
Так что если надо для фильмов и музыки - лучше кластер побольше ставить. 32КБ вполне пойдёт - как стандарт.