В отличие от MBR, который начинается с исполняемой двоичной программы, призванной идентифицировать и загрузить активный раздел, GPT опирается на расширенные возможности EFI для осуществления этих процессов. Однако MBR присутствует в самом начале диска (LBA 0) как для защиты, так и в целях совместимости. Собственно GPT начинается с Оглавления Таблицы Разделов (Partition Table Header).
GPT использует современную систему адресации логических блоков (LBA) вместо применявшейся в MBR адресации Цилиндр — Головка — Сектор (CHS). Доставшийся по наследству MBR со всей своей информацией содержится в LBA 0, оглавление GPT в LBA 1, а сама таблица разделов далее. В случае 64-битной версии ОС Microsoft Windows NT, за GPT зарезервировано 32 сектора или 16 384 байта, так что первым используемым сектором диска будет LBA 34.
