Ситуация в Хорватии была намного сложнее. Сербы составляли около 12% населения и, как правило, не поддерживали вновь избранное правительства Хорватии, а также независимость Хорватии. Они находились под постоянным обстрелом пропаганды сербских СМИ, которые насаждали страх повторения сербских погромов хорватскими формированиями ультра-националистов Усташей , которые происходили во время Второй мировой войны. Еще до того, как произошли фактические изменения, сербы в Хорватии провели несколько массовых митингов в поддержку Милошевича, часто с позиций сербских экстремистов. Примечательно, что усиление напряженности нашло отражение в ранее невиданных драках между хорватскими и сербскими футбольными болельщиками.
Ситуация только ухудшилась после удивительной победы Хорватских националистов. В действительности, ново избранное хорватское правительство было нацелено на поворот вспять анти-хорватский и про-сербский курс своих предшественников, делая это часто неумело и не очень заботясь о чувствах местных сербов, поэтому последние считали их политику националистической и исторически ревизионистской. К примеру, власти Хорватии крайне подозрительно относились к сербам в составе хорватской полиции, где их доля значительно превышала долю в населении, и намеревались побыстрее это изменить. Несмотря на тот факт, что сербы столкнулись с потерей привилегированного статуса, который они имели в Югославии, физически им ничто не угрожало. Так как их недовольство хорватским правительством подпитывалось сербской пропагандой, было сомнительно, что другой курс властей привел бы к существенно другим результатам. Например, пропаганда умело использовала даже самые позитивные действия, такие, как замена коммунистической символики на древние хорватские национальные символы (красный и белый в шахматном порядке), которые также использовали усташи, превращая их в доказательство намерений геноцида нового руководства. Примечательно то, что другие национальные меньшинства, представляющие 8% населения, не имели серьезных возражений против курса новой власти и даже активно участвовали в некоторых изменениях.
После того, как Хорватский парламент принял изменения в Конституции и заменил коммунистическую символику хорватской, сербы ответили на это так называемой «революцией бревен» в августе 1990 года. В тех районах Хорватии, где сербы представляли большинство, они блокировали дороги срубленными деревьями, в то время, как местные власти и полиция не признавали власть центрального правительства, они провели специальные “референдумы” и объявили автономию. Их требования постепенно возрастали до федерализации и независимости, подогреваемые тем, что хорватское правительство было беспомощным, чтобы действовать против них. Все усилия по созданию конституционного строя специальных полицейских сил были сорваны превосходящей по силам югославской армией.