По законодательству есть два способа введения новостроя в експлуатацию: общий (в случае соблюдения требований о получении всех разрешений и заключений, соблюдении всех нормативов, постройки здания по тому проекту, который изначально был согласован) - тот, который получаете ч-з ГАСК и, грубо говоря "специальный" - в судебном порядке, если сооружение построено или строится на земельном учатке, который не был отведен для этой цели, или без надлежащего разрешения, или без утвержденного проекта, или с нарушением строительных норм и правил.
Но если Вами это свидетельство уже получено, разницы между ними нету никакой (кроме того, что на Вас могут "насесть" пожарники, СЭС и др., за то, что получили его без их участия :0)))))))))