Альтернативы? Да пожалуйста... есть ещё Open и Net BSD
Есть много альтернатив, как свободных, так и проприетарных.
А что такое целостная система? Это как? Линух тоже целостная система... в моем понимании. А то, что дистрибов оч много, не означает фрагментации, а лишь предоставляет широкий выбор решений на базе одной и той же огромной кодовой базы утилит, программ, и системных прог.
А то, что популярных дистров Линукс можно по пальцам пересчитать, это тоже факт. Дистровотч вам укажет на самые-самые популярные
Фря не лучше и не хуже... она просто заточена под определенный круг задач... и может быть эффективнее линукса в некоторых сферах, но проигрывает в других из-за особенностей этой ОС. Вот и вся разница.
Лично я предпочитаю Линукс из-за бинарных пакетов, гуя в многих аспектах работы с системой (включая инсталляцию через гуй), и более свежих пакетов программ, и большего его количества в репозиториях.
Для решения моих задач я использую: Дебиан, Убунту, и Линукс Минт (для каждого компьютера отдельная ОС) ведь они просты в эксплуатации и внедрении... в моем случае