Агент Итан Хант бежит из российской тюрьмы, где содержался под именем Сергей Иванов. В Москве он получает новое задание. Террорист, известный под кличкой Кобальт, собирается проникнуть в Кремль и убрать своё досье из секретного архива. Шведский профессор Курт Хендрикс (он же Кобальт) проповедует безумную идею того, что очередная мировая война пойдёт только на пользу человечеству. Ханту не удаётся остановить врага, целью которого был также ядерный чемоданчик. Заметая следы, Кобальт организовал мощный взрыв Спасской башни Кремля, унёсший сотни человеческих жизней. Обвинение во взрыве и краже ядерного чемоданчика повесили на команду Ханта. Он и его люди остаются без поддержки и должны остановить ядерную катастрофу. Преследующий Итана российский спецагент Сидоров осложняет его и без того нелёгкую задачу.
