Кто-нибудь отправлял свою слюну на 23andme?

[-Viperrr-]

Не пользовался, раньше они уступали и FTDNA и 23&Me

Тут есть еще такой ньюанс. Количество SNP в ДНК чипе. Сами чипы все компании сейчас у иллюмины берут вроде, поэтому по качеству и точности примерно равны. Но вот количество снипов -это важно. Раньше у 23иЯ было 960 тысяч и при цене в 100 баксов они были супер, круче всех. Сейчас они порезали примерно до 300 тысяч -и это уже совсем не айс. У FTDNA было около 470 тысяч, сейчас вроде чуть меньше, но не намного.

При переносе данных из одной организации в другую будут отброшены те снипы, которые новая лаборатория не делает, а те которые она делает не добавятся -так что это отнюдь не одно и то же как сделать сразу в ней, качество инфы падает

Еще момент. Цель анализа. Если это здоровье -то база пользователей в принципе не очень важна (в 23иЯ был и есть хороший опросник с целью выявить связи между снипами и болезнями - но вообще этим занимаются многие энтузиасты, из той же прометеазы например), важнее чтоб набор снипов содержал побольше тех, которые связаны со здоровьем. Однако фармкомпании очень не любят конкурентов и такие наборы сейчас редкость, увы.

Подниму тему.
Не интересовались, что нового на этом рынке?

У всех сейчас скидки ))

 

[Old Monk]

И не дошло ли до Украины ?

 

[Хидр]

Заказал два набора, прождал два месяца, они не пришли. Деньги вернули.

 

[ja]

Отправлял в 2020. Месяца через два получил реzультат, но необработанный.

Обработку помог сделать один любитель этого дела, у которого куча опыта на раличных профильных форумах, за пиво
Прислал карту, где все расписано и красиво - на 30 процентов Швеция и 10% Латвия, 35-40 украинец, процентов 10 Босния и Герцеговина, немного Польша и немного Чехия, так примерно по памяти.

 

[ja]

В принципе -да, но вот вопрос какие (в смысле что они делают) - это пока наука не совсем точно знает. В 23иЯ есть специальный раздел на тему "сколько генома вам от неандертальцев досталось" Типично 1-3% для европейцев, чуть больше для азиатов и 0% для африканцев южнее Сахары (негров то есть).

Вообще, по современным представлениям, если собрать у всех людей уникальные куски неандертальского генома и "склеить их" -то выйдет примерно 20% от генома человека. Но у каждого доставшийся ему кусочек свой, и в итоге у одного человека более 3% редко бывает. В основном это интроны, т.е. "мусорная ДНК", но есть и ряд генов, отвечающий за устойчивость к болезням, обмен жиров и еще за что-то. Даже иногда говорят о том, что светлая кожа и глаза европейцев -тоже неандертальское наследие, но тут спорно.

Ну я читал в иностранных профильных журналах,
неандертальских генов намного больше в рай онах РФ таких как Пермский край, Коми, Западная Сибирь (север и центр региона), часть Восточной Сибири. Отсюда как мне кажется и такая звериная злоба русского отребья, они как раз оттуда едут.
Денисовцы - это по памяти центральный Китай и юг монголии.

 

[Нужно подумать]

А какая разница?
Образно говоря если ты свалился на проезжую часть оживленной дороги в разгар движения, то по тебе с равной вероятностью проедут и БМВ, и ланосы, и какие-нибудь жигули первой модели.

 

[Reset]

Ну я читал в иностранных профильных журналах,
неандертальских генов намного больше в рай онах РФ таких как Пермский край, Коми, Западная Сибирь (север и центр региона), часть Восточной Сибири. Отсюда как мне кажется и такая звериная злоба русского отребья, они как раз оттуда едут.

тобта, ти вважаєш, що саме там міжвидовий бар'єр там н спрацював?
Неандертальци й кроманьонци - не один і той самий вид. Не знайдено доказів вдалого кросвидового розмноження.

 

[ja]

Не понял вопрос и сарказм.

Кроме РФ в другом месте планеты всплеска этих генов нет.

Ещё к тому описанию надо само собой добавить Урал и южнее от Перми почти до Волги.

Ну и в профильных журналах есть описание как все происходило в течении многих тысячелетий. В динамике при чем.

 

[Burnash]

Ну я читал в иностранных профильных журналах,
неандертальских генов намного больше в рай онах РФ таких как Пермский край, Коми, Западная Сибирь (север и центр региона), часть Восточной Сибири. Отсюда как мне кажется и такая звериная злоба русского отребья, они как раз оттуда едут.
Денисовцы - это по памяти центральный Китай и юг монголии.

Я как раз склонен считать что никакой особой звериной злобой неандертальцы не отличались, иначе бы они истребили сапиенсов, а не наоборот. А высокий процент неандертальских генов в тех регионах - это следствие как дрейфа генов в малочисленных популяциях (во время последнего оледенения в тех краях возник изолят в западной Сибири). так и того что неандертальские гены дают устойчивость к суровым условиям среды. Так или иначе метисация сапиенсов и неандертальцев проходила дважды и оба раза в южных регионах - на ближнем востоке. и вероятно в причерноморье (это не точно). Дальше гены неандертальцев сапиенсы несли самостоятельно.

Что до Денисовцев -то не нужно путать те региоы где они жили (это действительно Монголия с окрестностями) и те ге живут их потомки (а это Океания в основном, австралийские аборигены несут много денисовских генов, что даже во внешности видно). Кстати, по новым данным денисовцы активно смешивались с неандертальцами и потому более справедливо оворить о денисовско-неандертальском компоненте у тех же полинезийцев. причем неандертальский у нних иной чем у европейцев (так как попал через денисовцев)

 

[Burnash]

тобта, ти вважаєш, що саме там міжвидовий бар'єр там н спрацював?
Неандертальци й кроманьонци - не один і той самий вид. Не знайдено доказів вдалого кросвидового розмноження.

Неандертальцы и сапиенсы активно скрещивались -и это подтвержденный факт. Это не сколько разные виды, сколько разные подвиды.

 

[Burnash]

Я кстати, склонен считать, что европейский фенотип - это в основном наследие неандертальцев. Крупный выступающий нос. крупные открытые глаза и т.д. Светлая кожа туда же. Но это спекуляция конечно )))

 

[Burnash]

Отправлял в 2020. Месяца через два получил реzультат, но необработанный.

Обработку помог сделать один любитель этого дела, у которого куча опыта на раличных профильных форумах, за пиво
Прислал карту, где все расписано и красиво - на 30 процентов Швеция и 10% Латвия, 35-40 украинец, процентов 10 Босния и Герцеговина, немного Польша и немного Чехия, так примерно по памяти.

Та это старое развлечение. Кластерный анализ по имеющимся выборкам. в 2012- было интересно, сейчас мне больше смешно. Особенно веелые приключения моего набора у 23иЯ. Вы венгр -вы идеально совмещаете балканы и северную европу с примесью Азии. я - бля, ну не гоните. Потом -вы точно метис англо-балканский. Я хватаюсь за голову. Потом -вы турок из Анатолии (ну слава богу, уже ближе).

Эффективность такого анализа прямо зависит от базы данных по регионам. У FTDNA благодаря агитации Арсанова огромная выборка по Чечне. И они безошибочно находят восточнокавказские компоненты. Но при те, по которым у них базы нет могут отнести к диким ебенеям.

Более интересно анализировать IBD сегменты. Но сложнее и я не видел чтобы какие конторы это делали. у любителей была только одна работа, любопытная у Сергея Козлова, но дальше дело не пошло.

Также я когда-то хотел усовершенствовать кластерный анализ , используя не весь геном в куче, а разбивая даные похромосомно. Это имеет смысл, так как если у человека сразу целая хромосома "условно африканская" -то его родство с жителями Чада и Судана куда выше чем это может оказаться по другим методам. Но потом меня охватила лень и я забил ))))

 

[_north]

Заказал два набора, прождал два месяца, они не пришли. Деньги вернули.

Они побоялись тебя огорчать

 

[ja]

Та это старое развлечение. Кластерный анализ по имеющимся выборкам. в 2012- было интересно, сейчас мне больше смешно. Особенно веелые приключения моего набора у 23иЯ. Вы венгр -вы идеально совмещаете балканы и северную европу с примесью Азии. я - бля, ну не гоните. Потом -вы точно метис англо-балканский. Я хватаюсь за голову. Потом -вы турок из Анатолии (ну слава богу, уже ближе).

Эффективность такого анализа прямо зависит от базы данных по регионам. У FTDNA благодаря агитации Арсанова огромная выборка по Чечне. И они безошибочно находят восточнокавказские компоненты. Но при те, по которым у них базы нет могут отнести к диким ебенеям.

Более интересно анализировать IBD сегменты. Но сложнее и я не видел чтобы какие конторы это делали. у любителей была только одна работа, любопытная у Сергея Козлова, но дальше дело не пошло.

Также я когда-то хотел усовершенствовать кластерный анализ , используя не весь геном в куче, а разбивая даные похромосомно. Это имеет смысл, так как если у человека сразу целая хромосома "условно африканская" -то его родство с жителями Чада и Судана куда выше чем это может оказаться по другим методам. Но потом меня охватила лень и я забил ))))

У вас судя по всему проблемы с географией, перечисленные страны все в Европе, из Азии нет ничего. Венгрии нет тоже. Анатолии нет тоже. Есть Босния.
А Кластерный анализ разработан лет 60 назад, если не раньше. Искать не охота, точно помню что пакеты есть начиная с Фортран-77. Так что тут ничего нового, выборку какую он брал не знаю, скорее всего те что бесплатно.
Так что ошибки наверное есть. Но они только в пропорциях, может быть, что Швеции не 30, а 20 и т.д.

Про то что не нужно смешивать где кто-то когда-то жил - согласен, там просто впервые открыли, в Монголии и Китае.

По поводу того почему неандертальцы именно там - есть обьяснение.
Несколько десятков тысяч назад их было больше даже и жили на Ближнем Востоке и в Средиземноморье. Наступающие с юга сапиенсы их начали теснить на север, хотя они и были намного мощнее физически и выше, более приспособленные.
Но их побеждали за счет оружия того времени которое не требовало прямой контакт, ну скажем стрелы и копья. Шло все с переменным успехом, но все же оружие Длинная Рука было намного более эффективное, против тупой мощи.
Сначала оттеснили с Б Востока, потом уже где-то 10000 лет назад и из Средиземноморья.

... сейчас похожая ситуация с ракетами-точными кстати против мясных штурмов.

 

[Штанген]

Мне написали - поздравляем, у вас больше генов неандертальца чем у 88% наших кастомеров.
Интересно в чем это выражается. Из древних атавизмов я только ушами могу шевелить.

 

[Tori]

Неандертальцы и сапиенсы активно скрещивались -и это подтвержденный факт.

В жизни б не дала неандертальцу, совсем фу.

 

[Нужно подумать]

В жизни б не дала неандертальцу, совсем фу.

А он бы спрашивал?

А вообще их придумали создатели тогдашнего ИИ.
А мы - честные птомки Адама и Евы.

 

[Burnash]

У вас судя по всему проблемы с географией, перечисленные страны все в Европе, из Азии нет ничего. Венгрии нет тоже. Анатолии нет тоже. Есть Босния.
А Кластерный анализ разработан лет 60 назад, если не раньше. Искать не охота, точно помню что пакеты есть начиная с Фортран-77. Так что тут ничего нового, выборку какую он брал не знаю, скорее всего те что бесплатно.
Так что ошибки наверное есть. Но они только в пропорциях, может быть, что Швеции не 30, а 20 и т.д.

Про то что не нужно смешивать где кто-то когда-то жил - согласен, там просто впервые открыли, в Монголии и Китае.

По поводу того почему неандертальцы именно там - есть обьяснение.
Несколько десятков тысяч назад их было больше даже и жили на Ближнем Востоке и в Средиземноморье. Наступающие с юга сапиенсы их начали теснить на север, хотя они и были намного мощнее физически и выше, более приспособленные.
Но их побеждали за счет оружия того времени которое не требовало прямой контакт, ну скажем стрелы и копья. Шло все с переменным успехом, но все же оружие Длинная Рука было намного более эффективное, против тупой мощи.
Сначала оттеснили с Б Востока, потом уже где-то 10000 лет назад и из Средиземноморья.

... сейчас похожая ситуация с ракетами-точными кстати против мясных штурмов.

Ну вы блин даете. какие к черту проблемы с географией? Историю того что писали 23ия я могу буквально по годам рассказать ( у них были даже перлы когда у меня субсахарская Африка обнаруживалась). Они МЕНЯЮТ географию по мере обновления своей базы. Когда я начал с ними работать, у них украинская выборка была представлена 15-ю (15) образцами, а российской не было вообще, они взяли треш из 1000genomes (а там чувак пробухал грант и взял все образцы в своем финно-русском селе на севере россии, в итоге все русские были генетически однородны с заметным финским компонентом, реальных русских относило из-за этого или к украинцам или к полякам)
Кластерный анализ разработан -ну да разработан, но проблема "калькулятра" при анализе генома никуда не делась -и вы можете с ней ознакомиться при желании. Что однако не мешает тем же 23иЯ их до сих пор использовать (хотя уже к 2015му стаоло ясно что оно не работает так хоршо как хотелось бы). Хотя с другой стороны кому оно стало ясно - тем, кто хочет до чего-то дорыться, у 23иЯ цель повеселить клиентов, у огромного числа геномных блогеров такая же. Ну кто-то еще гранты отрабатывает (я был удивлен тому наскоолько отстают публикации в профильных журналах от любительских исследований -ну тут уже научный бюрократизм виной)
Особенно ярко этот треш вылазит когда начинаете анализировать ископаемые геномы. Мало того что там ограниченный набор SNP, так еще и их сочетания сейчас смотрятся фантастично. но если разбираться -то можно понять что к чему.


К примеру Отци мой оракул (програмка для определения происхождения, урезанная версия его опубликована на гедматче, можете поразвлекаться) определял как 50% субсахарским негром, 25% семитом (обычно рандомную выборку каких-нибудь йеменцев или сирийцев выдвавал в зависимсоти от настроек) и 25% баском или сардинцем.
Выглядит как бред -но если полумать Отци был типичным неолетическим земледельцем, они вышли с ближнего востока и расселились по югу европы, их наиболее чистые потомки это как раз баски и сардинцы. И тут все складывается -Отци нес уже часть генов будущих басков, но при этом сохранял еще часть ближневосточных. из которых 25% совпала с современными семитами, а 50% исчезла и не встречается в популяциях, но так или иначе представленау субсахарцев (потому что генетическое разнообразие Африки огромно, все остальные сапиенсы сводятся к маленькой популяции выходцев из Эфиопии).

А когда берешь захоронения из Испании времен мезолита и им выдает саамов -то конечно можно за голову схватиться. но ведь саамы как раз потомки коренного населения Европы (чернокожего и светлоглазого). Кожа у них посветлела, но остальной геном в целом сохранился. Потому им часто еще Африку 23иЯ выдавало (и не только 23иЯ у профессора Макдональда его калькулятор тоже их к неграм забрасывал иногда)

 

[Burnash]

И точно такая же беда происходит если брать современные изоляты (горцев каких-нибудь). И хможет забросить вообще хрен знает куда. Напаример северный Кавказ очень сильно тяготеет к Скандинавии и людям оттуда постоянно приписывают заметную часть скандинавского или шотландского происхождения. Как я сказал выше, FTDNA благодаря большой чеченской выборке эту проблему исправили (23ия еще нет) - но это не отменяет того что у них могут быть другие проблемы того же рода.

 

[Burnash]

В жизни б не дала неандертальцу, совсем фу.

Так в основном сапиенсы трахали захваченных неандерталок, а не наоборот. Даже есть версия что неандерталец и человеческая женщина не могли произвести потомства, а вот наоборот -вполне. Что-то там с блокированием хромосом.